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El proyecto Bio4j de Era7 Bioinformatics ha sido seleccionado para el programa Google Summer of Code 2014 1/9/2014
El proyecto Bio4j de Era7 Bioinformatics ha sido seleccionado para el programa Google Summer of Code 2014 Google Summer of Code es un programa global que ofrece a los estudiantes becas para escribir código en proyectos Open Source. Google intenta identificar y financiar proyectos fascinantes como Bio4j.
Estamos entusiasmados de anunciar que Bio4j ha sido aceptada como mentoring organization para el Google Summer of Code 2014. Este ha sido el primer año que nos hemos inscrito y nos sentimos genial por formar parte de esta iniciativa.
Bio4j (www.bio4j.com), es una base de datos gráfica bioinformática que incluye la mayoría de los datos disponibles en UniProt KB (SwissProt + Trembl), Gene Ontology (GO), UniRef (50, 90, 100), RefSeq, NCBI taxonomy, y Expasy Enzyme DB. La versión actual (0.9) tiene 1.216.993.547 relaciones, 190.625.351 nodos y 584.436.429 propiedades. Bio4j es un proyecto de Oh no sequences! (www.ohnosequences.com), el grupo de investigación de Era7 Bioinformatics.
Bio4j proporciona un entorno completamente nuevo y potente para el querying y manejo de información relacionada con las proteínas. Dado que se basa en un motor gráfico de alto rendimiento, los datos se almacenan de una forma que semánticamente representa su propia estructura. Al contrario, las tradicionales bases de datos relacionales deben aplanar los datos que representan en tablas, creando identificadores artificiales para conectar las distintas tuplas; que pueden en algunos casos conducir a modelos de dominio que tienen poco que ver con la estructura real de los datos.
Era7 Bioinformatics ofrece a sus consumidores servicios a medida de alto valor adicional basados en la plataforma Bio4j.
 
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